Le métabolisme - Cycle de Krebs (3)
-> Le cycle de Krebs ou cycle du citrate a lieu dans la mitochondrie chez les eucaryotes...
-> Le cycle de Krebs peut se décomposer schématiquement en trois étapes
étape 1 : préparation aux décarboxylations de la molécule à six carbones.
Le citrate est formé par la condensation aldolique d'un acétyl-CoA avec un oxaloacétate, réaction couplée à l'hydrolyse d'un thioester. Lors de cette première partie du cycle de Krebs, le citrate sera transformé en isocitrate (isomère), celui-ci se différencie par la position d'un hydroxyle qui passe du carbone 3 (alcool tertiaire) au carbone 4 (alcool secondaire). Il faut noter que le carbone 4 provient de l'oxaloacétate.
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L'oxydation de cet alcool secondaire permettra le départ du premier groupement COO- porté par le carbone 3.
étape 2 : réactions de décarboxylations
L'oxydation de l'hydroxyle en C4 de l'isocitrate permet la formation d'un β-cétoacide, instable, qui se décarboxyle spontanément en α-cétoglutarate. Ce dernier subira une décarboxylation oxydative en succinyl-CoA, le deuxième COO- correspond au carbone 5 de l'isocitrate.
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Le succinyl-CoA obtenu sera transformé en succinate. La fin du cycle aboutira à la régénération de l'oxaloacétate.
étape 3 : régénération de l'oxaloacétate qui acceptera à nouveau un acétyl-CoA
A partir du succinate, une suite de trois réactions : oxydoréduction, hydratation, oxydoréduction, est nécessaire pour reformer de l'oxaloacétate. Ceci revient à convertir un méthylène (CH2) en carbonyle (CO).
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Le carbonyle de l'oxaloacétate sera le site de l'attaque du prochain acétyl-CoA, ce qui initiera un deuxième tour de cycle.
